Hoy en día las ruinas de la Basílica están 3.5 kms por la cuidad de Efeso. La Iglesia construida en el siglo VI por el emperador Justiniano el Grande y las ruinas que se ven hoy en día son del siglo seis. La Iglesia está construida encima de la tumba de San Juan y es una buena obra de construcciónes bizantinas de ladrillo y piedra. La construcción tiene una forma de la cruz griega y está cubierta por seis cúpulas. La Iglesia también está amurallada para protegerla contra los ataques árabes.